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文献解读 | 胸外科相关的转录组学文章!

來源:小博发布消息時间:2020-07-29

 

客户单位:首都医科大学

GGBet提供:

  • NCBI的GEO数据库中的数据下载

  • 高通芯片量生物工程信心进行定性了解(的差异进行定性了解,热图、职能数据通路聚集进行定性了解和当前数据转导网进行定性了解)

 

论文概述

以cisplatin为基础的化疗是治疗多种实体肿瘤的方法,但其疗效在很大程度上受到获得性耐药的限制。本文主要通过从GEO数据库中选取了7个癌细胞系的表达谱数据进行生物信息学分析,来确定与顺铂耐药相关的基因和通路,以及建立了肿瘤细胞顺铂耐药调控的信号转导网络。本文的特色在于:公共数据的自行挖掘!

 

数据库选取

数据选择包括肺癌细胞系A549和H460,卵巢癌细胞系A2780,口腔鳞癌细胞株KB-3-1和睾丸癌细胞系833K、GCT27和Susa这7组的芯片数据,如下表格所示。

 

差距数据分析

7组数据表格的聚类算法图相应图示。

 

工作和环路丰度浅析

  • 区别对7组差别的数据完成模块和环路生物富集深入介绍,下面只体现了要素警报环路深入介绍柱形图,如下已知图已知。

 
  • 系统含有深入分析以下面的电子表格方式产生,只呈现了各举两组数据报告。

 

当前走势转导数据网络

将7组相互影响人类表观遗传一块儿进行了一个静态电磁波转导线上。7组人类表观遗传的多次重复頻率由多种的红颜色提出。后来完成电子表格的组织形式搜集了线上中主要的的人类表观遗传。

 

的研究报告的格式

在这里7组癌神经细胞系中,有很多遗传遗传dna一定的不同之处描述。它注意各自操作了82个模块和11条数字数据信号数据信号通路。经过解析全局变量数字数据信号转导互联网某种有一定的不同之处遗传遗传dna的完美的功效,这其中CTNNB1、PLCG2和SRC这3个遗传遗传dna起非常核心区的的功效。本调查共建一种新的一定的不同之处遗传遗传dna描述方法,接下来进步的调查将为本病的诊断报告和治療提供数据新的靶点。


 


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