基因芯片类型(科研常用)
RNA层面:
mRNA芯片 ——Affymetrix Clariom D array
Affymetrix Clariom S array
Affymetrix Primeview array
miRNA芯片 ——Affymetrix miRNA 4.0 array(全物种)
lncRNA芯片 ——Affymetrix Clariom D array
circRNA芯片 ——Affymetrix Clariom D array
DNA层面:
SNP/CNV芯片——Affymetrix CytoScan HD array
Affymetrx CytoScan 750K array
甲基化芯片——— Illumina 850K
基因表达芯片分类
3’IVT芯片只能检测转录本3’端的外显子,而WT芯片可以检测转录本中所有的外显子,可以准确反映基因的表达水平,可以分析可变剪接的发生。目前最新版的全转录组基因表达芯片是Clariom D 系列——一款神级表达谱芯片,它有三项技术革新:
1. 全面检测——发现编码基因、lncRNA、环状RNA、外显子、microRNA(前体)以及可变剪切信息。
2. 快速检测——轻松快速发现鉴定重要注释明确的基因与信号通路,实验周期缩短至1周。
3. 大范围检测——可对血液、石蜡组织等降解样本,以及低至100pgRNA的微量样品进行转录组分析,充分挖掘样本信息。